负责编报局行政事业经费预算计划和决算报告，办理经费划拨、会计核算等事项，指导下属单位财务管理。负责水利等专项资金和补助经费的申报工作，并做好资金使用的监督管理工作。负责局机关事业单位国有资产管理及内部审计工作。负责政府采购监督管理。
