人口普查是我国十年一次的重大国情国力调查，人口问题是关系全局的重大问题，是考虑社会经济发展的一个基本出发点，基于此，国家、地方花费大量的人力、物力、财力来支持此项工作，并称之为“和平时期最大的社会动员”，人口普查在各种普查中的地位和作用不言而喻。人口普查要做到“人数点清、指标查准”，才能认清国情、掌握国力，才能为制定各种方针、政策及发展战略提供重要依据。自“五人普”以来，十年间，社会经济发生了深刻而巨大的变化：经济总量增长，经济结构调整，流动人口剧增，城乡面貌变化，人民生活改善，在这样复杂多变的背景下，做好第六次人口普查面临诸多困难：
1、流动人口登记困难。随着社会主义市场经济的发展，人口的迁移流动在不断增加剧，流动人口规模呈扩大之势，人户分离现象也大大增加。这些给确保人口普查不重不漏带来了挑战。一方面，频繁的人口流动本身给普查登记带来了难度，庞大而流动的人口使得查询工作十分困难，极易出现重登和漏登。另一方面，受局部利益驱动的影响，部分民营和私营企业单位故意少报外来人口或拒绝调查，主要缘于逃避劳动部门关于企业临时用工的政策，以及工商、税务部门的管理。此外，随着社会利益群体日趋多元化，社会现象的各种矛盾错综复杂，调查户的就业情况、劳动收入、婚姻状况等隐私不想被外人知道，这样外来人口就容易出现瞒报、漏报、误报、拒报现象。
2、查实超生人口存在阻力。普查数据质量很大程度上要受到瞒报出生人口的影响。受计划生育“一票否决”的影响，部分基层单位怕完不成计划生育管理目标，在统计报表上做文章，有意瞒报出生人数，尤其是计划外出生人数。从被调查者来说，部分人为能多生孩子或生男孩，同时要躲避惩罚，不仅瞒报计划外指标，而且也瞒报计划内指标。这些现象都增加了普查登记的难度。
3、群众配合程度下降。近年来，随着市场经济体制的建立，由于利益主体多元化，以及人们安全观、隐私观等价值观念的转变，加上社会上商业调查、市场调查的频繁增加，群众难以分辨国家调查与其他调查，对各种调查厌烦情绪较大，拒绝调查、回避调查等不配合调查的现象有所增加，有的人为了安全起见，不让调查员入户；有的出于职业隐私考虑，不愿配合调查，更有甚者根本就不同意调查。
4、选聘合格普查员难度加大。与经济普查和农业普查相比，人口普查调查涉及范围最为广泛，选聘的普查员数量最多，居委会、上规模的村需要选聘5名甚至10名以上的普查员，而这些普查员都需要具备一定学历、有责任心、并且对所在普查小区有一定的了解。在经历了多次普查后，部分普查员已经失去了对普查工作的热情，练就了一身应付“本领”，对待工作敷衍了事，反过来又将影响了其他有责任心的普查员。
普查环境变化大，普查员选调难度增加，流动人口规模大，群众配合程度下降，超生人口不如实申报等，诸多问题都给如实普查增加了困难。为保证这次人口普查的顺利实施，建议采取以下对策和措施：
1、宣传工作轰轰烈烈。人口普查既是国情国力调查，也是一项涉及千家万户的系统性工程。因此，既需要各级政府的高度重视，也需要广大群众的认真参与和大力配合，宣传工作要轰轰烈烈，家喻户晓，一是要做好对领导的宣传，加深他们对人口普查重要性的认识，使他们亲自抓普查工作；二是要做好对有关部门的宣传，以争取他们对普查工作的支持；三是要做好对广大群众的宣传，让他们明白人口普查最终与其利益息息相关，如实参加普查登记是公民应尽的义务。
2、“两员”要求兢兢业业。选聘阶段，要把“有责任心”放在突出位置，把之前几次普查工作推诿、应付了事的普查员筛选出普查队伍；培训阶段，要在每期培训会议开始请人普领导小组领导或人农普办主任讲话，重点突出对参加培训人员的责任心教育，对责任心缺失的危害性和加强责任心的重要性以及如何加强责任心等方面加以阐述，激发大家的责任感和使命感；建立考核机制，把工作责任心作为普查员补贴额度的重要依据，对因工作不负责任而造成损失的普查员削扣补贴，不得参加评优评先活动，对责任心强的普查员在精神和物质方面予以鼓励和奖励，适时塑造典型予以报道。
3、政策出台适度从宽。主要指计划生育政策，对于超生问题，在普查中从超生户到基层单位再到各级政府都存在顾虑，部分超生户由于罚款的原因而隐瞒出生子女，不敢申报户口，基层单位和各级政府担心计划生育政策的“一票否决”，不愿尽全力全面清查、登记超生人口。建议从国家、省级层面在法律允许范围内出台适度从宽的政策，鼓励超生对象及时到相关的行政主管部门上报超生子女的情况，准许其落实户口，同时在人口普查年份取消上级政府对下级政府的计划生育考核。这样可以调动超生户申报户口和普查登记的积极性，也可以调动各级人民政府申报和查准超生人口的积极性。
4、部门之间加强协作。解决人口普查中的难点问题，确保普查工作的质量，在很大程度上要依赖于有关部门的支持和配合，目前各地都成立了普查领导小组及其办公室，涉及公安、计生、宣传等多个部门，统计部门作为牵头部门，要充分发挥各部门的优势，真正把各部门联络员尤其是抽调人员当做普查人员，与统计部门工作人员一视同仁。人口普查是全国一项庞杂、系统的社会工程，不是哪一个部门所能完成得了的，他需要全社会各行业、各部门的全力支持，更需要广大普查人员的高度责任感以及敬业精神，才能圆满完成人口普查任务。